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• Tipo de ArquivoArquivo de AlinhamentoComprimido
• Binário
• O que é um arquivo CRAM?
• Sobre arquivos CRAM

Tipo de ArquivoArquivo de AlinhamentoComprimido

Desenvolvedor	EBI
Popularidade	3,0 (1 Voto)
Categoria	Arquivos de dados
Formato	Binário X Binário Este arquivo é salvo em um formato binário, que requer um programa específico para ler seu conteúdo.

O que é um arquivo CRAM?

Formato de arquivo de alinhamento comprimido desenvolvido pelo EBI, uma estação do Laboratório Europeu de Biologia Molecular; armazena alinhamentos de leitura de seqüência de DNA curto gerados a partir de alinhadores de leitura curta, como BWA, BBMap e BLAT. Mais Informações

O formato de arquivo CRAM é semelhante ao formato de arquivo Binary Alignment / Map (BAM), mas apresenta melhor compactação de arquivos e um formato de recipiente binário orientado a colunas reestruturado. À medida que os volumes de dados aumentam no campo do software genético, o formato CRAM foi projetado para reduzir a impressão do pé do disco dos dados de alinhamento.

O alinhamento de leitura curto é o processo de decifrar de onde uma sequência vem no genoma. Isso pode ser difícil, já que o genoma de referência é bastante grande e você nem sempre procura por correspondências exatas no genoma de referência. Alinhadores de leitura curta são usados ​​para pesquisar seqüências enormes para correspondências e correspondências aproximadas. Como as sequências são muito grandes, a compactação fornecida por formatos como o CRAM é necessária para manter os tamanhos dos arquivos gerenciáveis.

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janelas

Samtools

Atualizado em 1/11/2016

Sobre arquivos CRAM

Nosso objetivo é ajudá-lo a entender o que é um arquivo com um sufixo * .cram e como abri-lo.

O tipo de arquivo Alinhamento Compressed, a descrição do formato do arquivo e os programas do Windows listados nesta página foram pesquisados ​​e verificados individualmente pela equipe do FileInfo. Nós nos esforçamos para 100% de precisão e publicamos apenas informações sobre formatos de arquivo que testamos e validamos.

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